Ūdens vai jebkurš cits šķidrums, ievērojot gravitācijas likumus, tecēs lejup, ja atradīs sev izeju, kaut vai nelielu plaisu. Programmā Water Flow 3D jums ir jāļauj tai brīvi plūst, lai piepildītu kvadrātveida konteinerus, kas atrodas apakšā. Tvertņu skaits mainīsies, taču jāatceras, ka tajos var ieliet tikai attiecīgās krāsas šķidrumu. Lai to izdarītu, atveriet slēģus pareizā secībā. Dažkārt Water Flow 3D ir jāsajauc šķidrumi un jālauž stikla starpsienas ar smagām bumbiņām. Ir daudz līmeņu, un uzdevumu noteikšanā tie ir dažādi.