Lidojošo putnu žanra cienītājiem Flappy Ball 3D nedaudz mainīs saskarni un piedāvās kontrolēt basketbola bumbu, nevis putnu. Viņš ne tikai lidos gaisā, tevis atbalstīts, viņam vajadzēs arī ienirt sarkanajās stīpās, un tas ir obligāti. Par katru niršanu tiks piešķirts viens uzvaras punkts. Lidojot starp gredzeniem, parādās sirsniņas. Noķer tos, lai aizpildītu lielo sirdi horizontālajā joslā augšpusē. Kad tā būs pilna, aiz bumbas parādīsies sirds, kas to pastāvīgi pavadīs. Ja palaidīsit garām stīpu, bumba pazudīs un parādīsies sirds, kuru varat kontrolēt. Ja nebūtu sirds, Flappy Ball 3D spēle beigtos.