Ceļojot pa Galaktiku, pētnieks vārdā Toms pastāvīgi sastopas ar dažādiem seniem artefaktiem. Lai tavs varonis tiktu pie tiem, viņam jāatrisina dažādas mīklas. Jūs spēlē Puzzle Galaxies palīdzēsit viņam to izdarīt. Ekrānā jūs redzēsiet dizainu, kas sastāv no kubiem. Katrs no tiem iekšpusē tiks sadalīts vienādās kvadrātveida zonās. Katrā zonā jūs redzēsiet noteiktas krāsas bumbiņu. Izmantojot vadības taustiņus, jūs pagriezīsit kubus ap savu asi telpā. Tavs uzdevums ir iestatīt šos priekšmetus tā, lai visas bumbiņas būtu sakārtotas noteiktā secībā. Tiklīdz jūs to izdarīsit, jums tiks piešķirts noteikts punktu skaits Puzzle Galaxies spēlē, un jūs pāriesit uz nākamo spēles līmeni.
