Tālajā galaktikā starp abām svešzemju rasēm izcēlās karš. Jūs spēlē Clash of Aliens pievienojieties kādam no viņiem un komandēsiet armiju. Jūsu flote stāsies cīņā pret ienaidnieka kuģu estrādi. Ekrānā jūs redzēsit savu galveno kuģi. Zem tā būs vadības panelis. Ar to jūs nosūtīsit savus pilotus cīņā uz viņu kuģiem. Viņi uzbrūk ienaidniekam tos iznīcinās, un par to viņi jums dos punktus.