Jaunajā spēlē Ninja vs Ninja jūs dosieties uz pasauli, kur dzīvo boksa cilvēki. Starp abiem nindzju ordeņiem notiek karš, un jūs pievienosities kādam no tiem. Tavs varonis ir sarkanās kastes cilvēks. Viņš atradīsies telpā, kur viņa pretinieks ir zils. Starp tiem atradīsies dažādi šķēršļi un slazdi. Jums būs jāpārvalda jūsu raksturs caur visām šīm briesmām un jāuzbrūk pretiniekam. Izmantojot dažādus mešanas ieročus, jūs iznīcināt ienaidnieku un saņemat punktus par to.