Izrādās, ka vari skriet jebkur un spēļu pasaulē tas jau ir pierādījies ne reizi vien, tāpēc nav brīnums, ka spēlē Deep Sea Run tu palīdzēsi nirēja skrējienam dziļi zem ūdens pa dabisku tuneli. Viņš skrien nevis tāpēc, ka viņam patīk, bet tāpēc, ka cisternās ir ierobežots gaisa daudzums. Varonis nokāpa apakšā, lai izpētītu alu, un uzkāpa tajā. Pēkšņi notika sabrukums, un nabagam nekas cits neatlika kā meklēt citu izeju. Bet jums ir jārīkojas ātri, tāpēc varonis skrien ātri. Un tavs uzdevums ir palīdzēt viņam pārlēkt pāri plaisām, pieķeroties griestiem un atkal stāvot uz grīdas Deep Sea Run.