Mazas kolonijas, kurās cilvēki dzīvo izolēti, apmierināti ar to, ko paši ražo, pastāv visur uz mūsu planētas. Un, kā likums, viņiem tur nepatīk svešinieki. Taču spēles Colony Escape 2 varonis tikai pēta šādas komūnas un dzīvi tajās, tāpēc viņš bez atļaujas iefiltrējas kolonijās, līdz tiek izraidīts. N. bet šoreiz viņš negrib gaidīt, kad viņu izmetīs. Viņš iekļuvis aizliegtajā teritorijā, kamēr tur neviena nebija, un grasās nemanot doties prom. Tavs uzdevums ir atvērt visas durvis un piekļūt visam Colony Escape 2