Drosmīgs nindzju karotājs vārdā Kioto iestājās savas valsts slepenajā nodaļā. Viņa uzdevums ir likvidēt mafijas bosus. Šodien spēlē Stealth Master 3D tu palīdzēsi viņam veikt dažādus uzdevumus. Jums priekšā uz ekrāna redzēsiet savu varoni, kurš atrodas ēkas telpā ar ieroci rokās. Bruņoti apsargi staigās pa grīdu. Jūs izmantosiet vadības taustiņus, lai kontrolētu sava rakstura darbības. Jums būs jāpārliecinās, ka viņš zaglīgi pielavījās ienaidnieka priekšā un pēc tam sadūra ar zobenu. Tādējādi jūs nogalināsiet ienaidnieku un saņemsiet par to punktus. Tavs uzdevums ir šādā veidā atbrīvot visu sargu no sargiem un nogalināt priekšnieku.