Tālā apbrīnojamā pasaulē dzīvo tādas radības kā Pokemons. Viņi ir sadalīti grupās, kas pielūdz dabas garus. Reiz uguns un ūdens garu pielūdzēji veica rituālu un izsauca šīs dievišķās būtnes šajā pasaulē. Bet viņi izrādījās ļoti ļauni gari un izkļuva no kontroles. Tagad visa planēta ir haosā, un pastāvīgi notiek dabas katastrofas. Jums spēlē Pokemon Emerald Version būs jācīnās ar viņiem. Ekrāna priekšā jūs redzēsiet noteiktu apgabalu, kurā atradīsies jūsu rakstzīmes. Viņi uzbruks, piemēram, Uguns garam. Jūs vadīsit viņu darbības, izmantojot īpašu vadības paneli. Ar tās palīdzību jūs piespiedīsit Pokemon izmantot dažādas burvju burvestības, ar kurām viņi kaitēs pretiniekam.