No skolas fizikas un ķīmijas kursa jūs zināt, ka gandrīz viss uz planētas sastāv no atomiem, pat jūs un es. Tie ir ļoti mazi, un tos var redzēt tikai ar īpaši jaudīgu mikroskopu. Šīs daļiņas atrodas pastāvīgā kustībā, un tas ir normāli. Ja to kustība palielinās, objekts uzkarst. Bet spēlē Atomic Puzzle jums vajadzētu uztraukties par pavisam citu problēmu. Katrā līmenī jūs atšķirsit atomu ķēdes, padarot visu, kas bija uz spēles lauka, pazust. Lai nodrošinātu pazušanu, jums jāsaliek trīs vienas krāsas atomi, noklikšķinot uz viena no tiem. Izmantojot īpašus papildu bonusus, jūs varat mainīt krāsas, mainīt pozīcijas, sagriezt gabalus utt. Saprātīgi izmantojiet papildu īpašības, un tad jūs varēsit atrisināt mīklu. Bet, ja tas neizdodas, jūs vienmēr varat atkārtot līmeni, līdz sasniedzat vēlamo rezultātu.