No klostera, kurā dzīvoja un mācījās mūsu ninjas varonis, tika nozagti vērtīgi rituli. Burvju rīsi ir iespiesti uz plāna rīsu papīra. Ikviens, kas tos lasa, var kļūt par Debesu impērijas valdnieku. Vērtīgi artefakti gadsimtiem ilgi tika glabāti kešatmiņā, bet kādam izdevās tos nozagt un aiznest. Sensejs nosūtīja savu labāko studentu meklējumos, bet bez jums viņš nevarēja tikt galā Ninja Run. Ar puisi sastopas ne tikai slikti cilvēki, bet arī īsti ļaunu samuraju dēmoni no pazemes. Dzīves laikā viņi bija kvalificēti karotāji, un pēc nāves viņi sāka kalpot velnam, un viņu spējām tika pievienotas maģiskas prasmes. Ninja jāskrien, jālec un jāmet tērauda zvaigznes, lai tiktu galā ar ienaidniekiem.
