Senajā Japānā bija Ninja kareivju ordenis, kas cīnījās ar dažādiem valsts ienaidniekiem un monstriem. Šodien mēs esam spēlē Ninja Defender, mēs palīdzēsim vienam karam ienākt templī un izpildīt viņa pasūtījuma vadītāja pienākumus. Mūsu varonis, kas ceļo pa templi, iekļūst viņa zāles. Viņus uzbrūk dažādi monstriem. Mūsu raksturs izmantos ieročus ļoti līdzīgi kā bumerangs. Noklikšķinot uz ienaidnieku, mēs viņu nogalināsim, un tad objekts atgriezīsies. Mums būs jāpārvieto šis raksturs, lai viņš to atlaidinātu un tādējādi atkal iemeta. Ja mums nav laika to darīt, mēs zaudēsim ieroci un zaudēsim kārtību.
