Donky Kong pērtiķu karalim ir jāsniedz savu priekšmetu laimīgo dzīvi, un tas lielā mērā ir atkarīgs no banānu pārpilnības. Nesen klimatisko izmaiņu dēļ banānu raža ir ievērojami samazināta, un pērtiķu kopienā sākās fermentācija, un tur bija neuzticēšanās karaļa. Donkey Kong Run spēlē jūs palīdzēsiet pērtiķu monarham atjaunot savu reputāciju kā spēcīga un taisnīga valdnieka. Viņš skrien no visām kājām, un jūs piespiedīsit viņu lēkt pāri dažādiem bīstamiem šķēršļiem un savākt banānus Donkey Kong skrējienā.