Kad vīruss uzbrūk, organismi cenšas ar to tikt galā paši, taču ne vienmēr to ir pietiekami daudz, tāpēc jāpalīdz ar dažādām zālēm vai vakcīnām. Spēlē Kill the Virus jūs nonāksit procesā un palīdzēsiet pelēkajai šūnai cīnīties pret daudzu sarkano vīrusu uzbrukumiem. Viņi uzbruks no visām pusēm, un jūs piespiedīsit pelēko šūnu, lai tā atšautos. Katra misija stiprina vīrusu, tas kļūst stiprāks un grūtāk iznīcināms. Tavā šūnā ir desmit dzīvības, parūpējies par tām, kad tās beigsies, šūnā Kill the Virus būs vīruss.