Jūs droši vien zināt par fantomiem vai spokiem no zinātniskās fantastikas filmām un grāmatām, taču spēles Phantom Manor varone vārdā Ešlija spēj redzēt spokus, lai gan tas nenotiek tik bieži. Pirmo reizi viņa ieraudzīja spoku, kurš parādījās laikā, kad tika nozagti meitenes ģimenei piederošie dārgumi. Kopš tā laika viņi bija neveiksmes vajātāji, un viņi bankrotēja un bija spiesti pārvākties no ģimenes īpašuma uz nelielu māju. Varone vēlas atgriezties pie savas iepriekšējās labklājības un plāno atrast fantomu, viņa ir pārliecināta, ka viņš ir kaut kādā veidā iesaistīts. Taču šim nolūkam viņai būs jāiefiltrējas savā bijušajā savrupmājā Fantoma muižā.
