Dažādu krāsu kubu grupa, kas ceļoja pa pasauli, iekrita slazdā. Varoņi nonāca cietumā, un spēlē Zero Squares jums būs jāpalīdz viņiem izkļūt no tā. Pirms ekrānā redzēsit telpu, kurā atradīsies jūsu kubs. Jūs varat izmantot vadības taustiņus, lai kontrolētu tās darbības. Kaut kur telpā jūs redzēsit portālu, kas ved uz nākamo spēles līmeni. Jums būs jāveic kubs pa noteiktu maršrutu un jāizveido tā, lai tas nokļūtu portālā. Pa ceļam var rasties šķēršļi, no kuriem tavam varonim būs jāizvairās.