Naruto jau sen nav nemierīgais pusaudzis, kurš nezina savas spējas, taču joprojām ir grūti viņu saukt par gudru nindzju pieredzi. Neskatoties uz to, viņam ir komanda, un viņi ir gatavi cīnīties ar tumšajiem spēkiem par tiesībām kļūt par lielisku šinobi vadītāju. Spēles posmā Ninja Runner Runato jūs varat palīdzēt varonim sakaut nākamos ienaidniekus, kuru plūsma neizžūst. Pretinieku skaits ir liels, un varonis ir uzstādīts ātrumā. Viņš ātri skrien, un jūs liktu viņam reaģēt uz tuvojošos šķēršļiem - gan dzīviem, gan nedzīviem.
