Otrajā spēles daļā Ninja 2. darbība mēs atkal palīdzēsim drosmīgajām nindzēšanas karadarbībām izpildīt dažādas misijas, kuras viņiem uzticējuši viņu rīkojumu vadītāji. Mūsdienās mūsu varonim būs nepārprotami jāieplūst dažādās ēkās. Tā kā nakti pils un pilsētu vārti parasti ir slēgti, mūsu raksturs uzkāps sienas. Izmantojot īpašus pielāgojumus, mūsu varonis darbosies pie sienas. Ceļā būs dažādi šķēršļi un slazdi. Lai neiegūtu viņus, jums būs jānoklikšķina uz ekrāna, un tad mūsu ninja būs lēkt uz skrējiena uz pretējo sienu. Tā viņš ieies ēkās.