Jaunajā spēlē Running Ninja jūs dosities uz Seno Japānu, lai palīdzētu drosmīgajam ninja kareivim nodot ziņojumu imperatoram no viņa ordeņa saimnieka. Tavs varonis noteiktā maršrutā skrien cik ātri vien var. Pa ceļam sekojot jūsu varonim, nāksies saskarties ar dažādiem šķēršļiem un slazdiem. Jums būs jāizmanto vadības taustiņi, lai liktu varonim lēkt un lidot cauri visām šīm briesmām. Ja viņš sastopas ar ienaidniekiem, viņš tos varēs iznīcināt ar savu metamo ieroču palīdzību.