Spēlē Ben 10: Brains vs Bugs jums būs jāpalīdz smieklīgam zaļajam citplanētietim atbrīvot savus nolaupītos draugus. Jūsu priekšā ekrānā būs redzams jūsu varonis, kas atradīsies noteiktā vietā. Izmantojot vadības taustiņus, jūs vadīsit viņa darbības. Jūsu varonim būs jāiet pa noteiktu maršrutu, pārvarot dažādas lamatas un citas briesmas. Pa ceļam viņš savāks zelta monētas un citus noderīgus priekšmetus, kas dos jums punktus spēlē Ben 10: Brains vs Bugs un var dot varonim dažādus bonusus. Turklāt jūsu varonim būs jācīnās ar kļūdām, kuras viņa ceļā sastapsies.